Pokud chceš tohle, tak to chceš vcelku zbytečně. Co ti to přináší? Nic ... jen problém.
Pravděpodobně chceš oddělit provoz zaměstnanců od návštěvníků. Ale to musíš jinak ... pomocí VLAN na switchích a pomocí různých access pointů (což splní i virtual-ap na mikrotiku). Prostě je musíš oddělit i na nižší vrstvě, než L3. Pak ano, pro každý interface můžeš definovat různé DHCP servery. A můžeš i oddělit provoz těch dvou (či více) segmentů, protože víš, že se ti nepotkají nikde jinde, než v tom routeru.
Identifikace na DHCP probíhá podle MAC adres a server sedí na jednom rozhraní. Lze to dělit i třeba podle option82, což je informace kterou umí vkládat některé switche (pak poznáš, z jakého switche a jakého portu to jde). Ale naprosto netuším, jestli to podporuje i mikrotik.
Chceš-li mermomocí jen podle IP identifikovat zaměstnance, tak si holt musíš pohrát a každý takový počítač definovat na DHCP serveru staticky podle MAC.